根據《自由時報》報導，教育部主秘廖興國24日深夜受訪，表示部分高中學生於今年9月5日至9月20日期間，上傳校內學習歷程平台之「109學年第2學期學習歷程檔案」遺失，而遺失原因則是因為廠商模式設定錯誤，造成疏失。

委外廠商發聲明表示：「公版模組目前搬移到集中機房，因其中有3台硬碟在一開始建立時，模式設定錯誤，系統更新重新開機後，硬碟被還原，約有118校要進行資料搬移，目前已重新設定硬碟並掛載，預估本週六完成。」廠商坦言：「本人疏忽造成不便請見諒。」

傳出這次受害學校包含台中女中、台中高工等118所學校，約有上萬名高中職生受波及。有高中教師表示，學習歷程檔案「公版模組」是教育部國教署「以一套系統通用全國學校」，而不採用各校自己的校務系統，但此公版模組的委外廠商這次卻出現如此嚴重的疏失，嚴重衝擊大家對高中學習歷程檔案的制度信任，「高中學習歷程檔案資料安全性出包，引發信任危機。」

目前國教署以保障學生權利為前提，目前要求廠商全力救援硬碟資料，廠商也已委請專業技術人員協助處理中，初步了解資料硬碟並未損壞，將朝「儘快將硬碟中之相關檔案回復」之方向處理。

不過，教育部25日下午發表聲明，表示這次初步評估受波及的學校有81所，受到影響的高中職生有7,854人、資料則有2萬5,210件，其中包括課程學習成果9,793件、多元表現1萬5,417件，較先前傳出受影響的學校數、學生數少。