指揮中心表示，符合AZ疫苗第二劑接種對象，包括7月22日前已接種AZ第一劑之55歲至18歲民眾，以及7月30日前已接種AZ第一劑之56歲以上民眾；符合BNT第一劑接種對象，包含47歲以上民眾、22至12歲民眾，以及18歲以上第9類對象。

第11輪疫苗意願登記截止時間至至10月6日中午12時，預約時間為10月11日上午10時至10月13日中午12時，施打時間落在10月15日至10月21日。指揮中心表示，針對滿12歲至17歲之學生/青少年，請家長或監護人於預約接種當日，陪同至醫療院所或接種站，於現場簽署接種評估及意願書。

針對部分民眾7月接種第一季莫德納疫苗後，至今仍無法接種第二劑，指揮中心發言人莊人祥透露，「大概最近就會有莫德納疫苗會來」。另外，由民間企業共同捐贈的第五批BNT疫苗27萬劑，已於4日上午順利運抵桃園國際機場，疫苗效期至2022年2月10日，完成通關程序後，直接運送至指定冷儲物流中心進行後續檢驗封緘作業。

10月1日至3日新增338件接種疫苗後不良事件，其中8例死亡，死亡個案中，3例為AZ、4例莫德納和1例BNT。針對國內首起接種BNT後死亡事件，莊人祥表示，個案是48歲男性，9月18日接種後返家，9月29至30日出現頭痛、手臂痠痛症狀，10月2日胸痛、全身冒冷汗，送醫急診不治，個案本身有慢性肝炎、高血壓等慢性病，目前死因還在由檢察官跟法醫研判中。