台北市副市長蔡炳坤建議中央，由於台北市開設接種量能有限，遠遠超過預約人數，導致民眾搶不到名額，應立即修正而減少民怨。對此，陳宗彥表示，以過去經驗而言，各地方醫療量能應足以因應，也優先讓地方政府知道符合預約資格人數，再由地方依照醫療量能開設接種站。

陳宗彥解釋，過去1922疫苗接種系統先提供符合預約資格人數，再由各地方政府依造符合資格人數安排接種，皆足以因應，相信這次各地方政府也足以因應；指揮中心也會在施打疫苗前，盤點出各地方符合資格疫苗數量，協助地方調整量能。

不過，根據指揮中心公布的「六都接種量能表」數據，台北市預約AZ資格人數達12.7萬人，開設接種量能卻僅6.2萬名，接種量能比僅49.2%；至於BNT接種，台北市預約BNT資格人數達14.3萬人，開設接種量能僅5.6萬名，接種量能比僅39.53%，相比之下，台北市的接種量能比皆低於其他五都。

指揮中心發言人莊人祥表示，地方若有量能不足的問題，中央也會協助增設站點，例如針對人口較多的雙北加開接種站；而台北市此次開了較少的接種站，中央也協助規劃5個BNT接種點，包括衛福部一樓、交通部一樓、華山文創園區C2館、中正紀念堂一展廳和台灣當代文化實驗場，總共加了45,280劑。