蔡炳坤表示，市府根據中央預約系統資訊，要求台北市的醫療院所開出量能，但每一期預約狀況都有落差，當報到不如預期，結果導致醫療資源浪費及醫護人員空等，「我想這是每家醫療院所的共同心聲。」

針對第12輪疫苗，蔡炳坤說，可以說是「史上最複雜」，除了BNT第1劑、AZ及莫德納第2劑等3種疫苗同步接種，還分成10月22日至27日及10月28日至11月3日兩階段施打，整體提供的量能將會超過需求，因此他也請市民不用擔心，第一階段預約不到，第二階段一定能預約到。

蔡炳坤指出，台北市的醫療量能是每天穩定提供約4萬多人次施打，因此不可能這週突然配合中央要求拉到2倍，下週又降低；醫護人力不能壓榨、醫療品質不能犧牲，希望能互相理解，如果穩穩打，每週可以打到20多萬人，一個月可以打到100多萬人。

蔡炳坤還說，中央這輪第一階段爆量通知41萬人預約、第二階段僅通知18萬人，兩階段預約量分配不均，中央要思考該通知多少人預約，否則會造成民怨。

不過，對於中央協調加開5個站點施打BNT疫苗，蔡炳坤也表示，中央能及時協助「還是要說一聲謝謝」，只要能順利接種在市民身上，都要感謝。