教育部表示，高中生學習歷程檔案學校平台，因人員設定錯誤導致部分學生資料遺失事件，所有有意願重新上傳檔案的學生，於10月26日已全數完成上傳，教育部並於11月12日將「高級中等學校學生學習歷程檔案學校平臺資料遺失事件檢討及精進作為」書面報告函送立法院。

而國教署署長彭富源事發後，即以口頭及書面提出負起行政督導責任，並於學生完成上傳後，再次就行政督導疏失，提報自請記過處分，相關人事行政懲處程序由教育部續辦理。

教育部經檢討後，針對系統營運、維運、資安等環節，強化機房管理專業能量、加強備份監控並落實還原演練、建立系統重大變更多重驗證及複核機制，並爭取國教署設立資訊（安）專責單位。

教育部表示，現行學習歷程檔案公版模組委外團隊的管理效能不足，需要投入更龐大的資源方能完善，另公版模組多次調整後仍然無法完全符合各校需求，考量現今已有多家廠商開發出更多元、更能客製化的學習歷程模組，國教署將不再與暨大續約辦理公版模組計畫。

後續國教署會將資源投入在支持使用公版模組之學校依需求選用與其校務行政系統相容性高的學習歷程模組進行轉換，以確保學生學習歷程檔案作業順利。