外交部長吳釗燮7月時宣布規劃將於立陶宛首都維爾紐斯（Vilnius），以台灣名義設立代表處，國發會主委龔明鑫10月底率團考察立陶宛時，便曾透露「駐立陶宛台灣代表處」年底前就會成立。外交部18日表示，我國「駐立陶宛台灣代表處」於11月18日正式成立並掛牌運作，首任駐立陶宛大使將由現任駐拉脫維亞代表黃鈞耀出任。

外交部也在推特上發文，提到台灣代表處已經啟用，且已做好準備擴大與歐盟成員國交流，亦非常感謝立陶宛政府與世界各地朋友們在背後的支持，讓我國能成就這美好的一天。

此外，外交部提到，台灣與立陶宛在半導體、雷射、金融科技等各領域上，具有龐大合作潛力，而在先前10月底中東歐三國經貿投資考察團問立陶宛時，台立雙方簽署了6項合作備忘錄，希望往後能密切合作、奠定友好堅實的合作，並在共享的價值上促進雙方人民友誼。此外，駐立陶宛台灣代表處往後將負責立陶宛境內所有事務，駐拉脫維亞代表處則負責拉脫維亞並兼轄愛沙尼亞境內事務。

針對駐立陶宛台灣代表處設立一事，中國曾對此大表不滿，也以撤回中國大使的方式表達抗議，並以政治、經濟多種手段制裁，「對華政策跨國議會聯盟（Inter-Parliamentary Alliance on China，IPAC）就曾呼籲全球民主國家應共抗北京霸凌。

立陶宛議員馬爾戴基斯（Matas Maldeikis）當時坦言中國的舉動的確是一項壓力，但他認為立陶宛有自身利益要顧，與台灣合作對經濟與高科技產業能帶來莫大幫助，也有必要支持世界上任何民主國家，馬爾戴基斯更稱中國大使半年後就會回去。

立陶宛外交部長藍斯柏吉斯（Gabrielius Landsbergis）9月出訪華府時透露，立陶宛企業的確有感受到來自中國的壓力。不過18日駐立陶宛台灣代表處成立後，藍斯柏吉斯認為與民主國家建立的關係是基於法治原則，能建立更加長久的經濟關係、更符合立陶宛利益，也曾提到會加強與亞洲、印太地區的關係。

而藍斯柏吉斯的祖父維陶塔斯藍斯柏吉斯，是立陶宛1990年重獲獨立後的第1任元首，18日同樣到場恭賀，駐立陶宛台灣代表處在自由民主新立陶宛「國父」見證之下掛牌運作，意義非凡，藍斯柏吉斯甚至還用「歷史性的一刻」來形容。