雙城論壇將由柯文哲及上海市長龔正以視訊主持，北市府發言人陳智菡23日指出，市府已向陸委會報備，陸委會也表示樂觀其成。不過，24日陸委會卻表示，沒有樂觀其成，只是善意提醒及幫助，若論壇踰越城市交流，陸委會將採取必要措施。

對此，柯文哲24日出席「智慧政府，市民e同行」記者會時回應，自己在5月初曾拜訪陸委會主委邱太三，舉辦雙城論壇前也已和陸委會說明，論壇上要簽署的備忘錄（MOU）也有事先報備。

柯文哲進一步強調，雙城論壇不會涉及意識型態、統獨議題，而是單純的「2個城市之間的交流」，包括貓熊的照顧、國樂團等文化交流，他也強調：「我們會謹守身分、處理民生議題，陸委會不用太擔心啦！」

針對中國政府開罰遠東集團一事，柯文哲是否還會堅持「兩岸一家親」的立場？柯文哲則坦言，舉辦雙城論壇是吃力不討好的事情，但他認為，因為有衝突才需要溝通，如果沒有問題，就不用湊熱鬧。

但是，他透露，自己非常擔心「惡意螺旋」，雙方看不順眼的情況越來越嚴重，務實來說，不應該為了短期利益犧牲長期利益，也不要為了政黨利益犧牲國家利益，兩岸之間確實有分歧和隔閡，甚至是對立，但不應該造成兩岸人民互相仇視，保持善意才是維持兩岸和平最重要的基礎。