根據日本《共同社》報導，這名男子28日晚間抵達東京成田機場，當時就有發燒症狀，採檢後確診。由於男子從Omicron高風險地區、非洲南部的納米比亞入境，當局不敢大意，將檢體送傳染病研究所，證實感染上Omicron變異株，目前已經在檢疫所隔離，與他同行的另外2名家人篩檢結果為陰性。

為了防範Omicron威脅，日本首相岸田文雄29日宣布，從30日零時起，全面停止開放外國人入境，包括商務客和留學生等，該禁令暫行1個月，視情形也可能延長。岸田強調，這是為了慎重起見所採取的臨時措施。

日本也從27日起強化邊境管制措施，從南非、辛巴威、納米比亞、賴索托、史瓦帝尼、波札那、尚比亞、馬拉威、莫三比克等9國入境的日本公民，須在國家指定的防疫旅館內隔離10天，並在第3天、第6天和第10天接受篩檢。