侯友宜16日參加「2022新北市鐵道馬拉松接力賽宣傳記者會」，在接受媒體訪問時，有人提到農委會主委陳吉仲的父親是養豬農，還說開放萊豬之後也沒有豬農上街抗議，侯友宜對此則表示，父親這一輩子都沒有賣過萊豬，個人也相當反對含萊克多巴胺的豬肉，這是因為大家對食安充滿疑慮，也不期待吃到不安全的萊豬。

接著侯友宜說到，這陣子他前往菜市場視察，4,100多攤都寫「台灣豬最好吃，我們不吃萊豬」而孩童的營養午餐食材也都要經過把關檢驗，連最難檢驗的豬肉加工製品也還是嚴格抽驗。然而萊豬進來後，若把關加工製品有一定困難，「倒不如大家都不要用萊豬，吃台灣豬最可靠、最安全也最好吃。」

至於國民黨將由黨主席朱立倫率領黨員，17日公投選前之夜在自由廣場舉辦活動並夜宿，是否會一同參與該活動？侯友宜則回應已經清楚表達對公投的立場，「希望公投就讓人民經過理性科學的論證以後，自主地做決定，這才是公投本身的意義。」