根據高雄地檢署起訴書，曾麗燕於2010年12月起歷任高雄市議會（縣市合併後）3屆議員，在擔任高雄市議長期間，她竟指示胞妹曾麗鴻、助理曹雪禎採「虛報人頭」及「低薪高報」等方式，詐領助理費，金額高達新台幣1,330萬元。

高雄市議員每月可申請24萬助理費，最多可聘用8名助理，等於聘滿時，每年申請總額可達288萬元。檢方發現，曾麗燕、曹雪禎等人要求應聘助理交出存摺及印鑑，等薪水入帳後，再由曾麗燕、曹雪禎持存摺及印鑑提領，發「現金」給助理。

議員辦公室每月向議會申報助理薪資，每名助理申報4萬元，但經過曾麗燕後，實際卻僅領2.5萬至3萬元不等。檢方認為，公費助理補助費（含春節慰問金）是公費助理在職務上取得報酬，受領人應為公費助理，須專款專用，議員不得據為己有或挪為他用。

此外，檢方還查出，當助理曹雪禎離職後，竟然仍繼續以助理名義、擔任「人頭」詐領助理費，將詐領來的款項，用於服務處水電、餐費、電話費等雜支。

雄檢偵查時，曾麗燕坦承不實申報助理費，但辯稱是助理沒有提醒法規修正，議會也沒告知，因此她以為助理補助費、春節慰問金等可以作為個人使用，才按慣例為每位助理申報4萬元薪資，用以繳納黨費、會費、卡費等支出，否認利用職務機會詐取財物貪汙。

高雄地檢署偵結後，依貪汙治罪條例、偽造文書罪，起訴曾麗燕、曾麗鴻及涉案助理等13人，考量部分助理因偵查中坦承犯行，無前科、態度良好，建請法官予以緩刑自新。

對此，曾麗燕表示，從事公職以來，對監督市政與為民喉舌，全力以赴，從無懈怠、亦無辜負。面對助理費案起訴，深感遺憾，靜待司法判決，也將透過司法程序力證清白；國民黨高雄市黨部則表示，尊重司法調查，一切依照黨內規定辦理。