行政院長蘇貞昌日前拋出防疫、經濟並重的「新台灣模式」防疫戰略，引來台北市長柯文哲、新北市長侯友宜呼籲，中央政策要明確，是要清零還是與病毒共存。

陳時中4日進一步解釋「新台灣模式」，即維持正常生活並同時積極防疫，鼓勵全民都能做好自主應變措施，「若雙北有防疫上的問題可以行文中央，會一一解答。」

關於防疫怎麼做，柯文哲5日早上在新竹市跑行程表示「我們絕對比他更懂」，而就算有問題，陳時中旁邊的醫師張上淳、羅一鈞、王必勝等人，一通電話去就知道。

面對柯文哲的說法，陳時中5日下午在疫情記者會中回應，如果柯文哲懂最好，就不用來行文。陳時中也強調自己的說法，是「如果」不懂，可以行文來溝通，而不是說柯文哲不懂，「懂的話最好，就趕快做。」

不過，柯文哲也解釋，疫情一定會蔓延，一開始邊境連續2週以上破100例，他就知道國內產生感染閃不掉，如果要開放台灣的邊境，病例就會進來，因此，如何維持在境內低度感染，這要先說好，「每天新增多少個案數，是大家可以忍受的。」這也是為何他要向指揮中心喊話。