國民黨台北市長參選人蔣萬安：「所以我說過這是一個集體的向下沉淪、集體的墮落，我想民眾看得很清楚，台大的教授們，他們經過很縝密的討論，國際的標準，就做出了判定，所以這個部分民眾，其實很清楚，你要相信台大，還是相信民進黨隻手遮天，就是這樣。我也強調學術自主，它的重要性。絕對不能因為選舉利益，為了政權拋棄誠信、毫無是非，扭曲事實。」

針對蔡英文對黨內的喊話，蔣萬安相當不以為然，其實不只國民黨提出質疑，在民進黨內部也傳出，英系立委蔡易餘認為，黨中央在衡量論文門事件時，其實應該要考慮社會上不同的聲音，如果只是用審核的程序問題去質疑台大，社會可能也不會輕易接受。