中選會規定，獨立參選須達到28萬9,667份的連署書門檻，才能正式登記參選總統大位；若連署未達門檻人數的二分之一，意即14萬4,834份連署書，根據《總統副總統選舉罷免法》第23條規定第1項、第4項規定，將無法領回保證金100萬元。本次10組裡有5組被連署人未提出連署書件，除了郭台銘及賴佩霞，其餘皆未通過門檻。

其中前槍擊要犯藍信祺登記被連署人，提出連署人數151人，中選會實際清點為146人，刪除連署人數88人，合於規定的連署人數為58人；曾經以無黨籍參選台中市長落選的單親媽媽陳美妃，提出「每人每月普發現金3萬」政見，提出連署人數25萬5410人，實際清點為25萬6773人，不過刪除連署人數高達25萬6771人，合於規定之連署人數竟只剩2人。

台澎黨主席鄭自才也是被連署人，他過去曾計畫開槍行刺蔣經國，提出連署人數608人，實際清點為608人，刪除連署人數135人，合於規定之連署人數473人，是本次連署人數第二高，不過與郭台銘相差極為懸殊，且未達到法定門檻，一樣必須沒收100萬保證金。