台灣大學新版畢業證書上「民國紀元」遭刪，引起師生議論，23日舉行校務會議時，現任校長陳文章表示，畢業證書改版是在前任校長管中閔任內提出，直至今年8月29日行政會議上通過，更改的原因是為了與國際接軌，所以統一採用西元，也指出能理解學生相當重視畢業證書，將會調查學生意見，並在下次校務會議上討論說明。

對此，台大再次發出聲明，指出畢業證書改版作業自前校長管中閔任內即開始討論，起因是當時學生反映希望能將中英文畢業證書整合為一張，比較方便，過往中文版畢業證書為民國紀元，英文版畢業證書則為西元，不過如果中英文同列於一張證書中，內容甚多、印製空間不足。

台大指出，因此今年8月底時，由各學院院長與一級主管參加的行政會議上，共同討論後選出只保留原先英文畢業證書中的西元版本，方便畢業證書在國外使用，表示此事並非校長陳文章個人決定，也與政治完全無涉。

至於被提及的前校長管中閔，在23日晚間5點半左右，透過個人臉書發文回應此事，表示「本日中午去台中演講，傍晚始回，卻發現莫名其妙中了一槍」，他澄清自己任內因推動「校學士」，雖討論過如何在畢業證書上增列此一跨領域的資格，但此一討論並未涉及其他內容。