根據寶可夢官方發布的排隊規則，1月份元旦及每個週六、日，皆須排隊領取「入店整理券」，平日週一至週五則無需排隊即可入場，入店整理券的發放時間則是上午9點至10點45分，會依當日人潮狀況調整時間，發放地點則是台北市信義新天地A11入口（香堤大道廣場側）之指定場所。

根據「台灣寶可夢（神奇寶貝）同好聯盟」臉書粉絲團的資訊，「寶可夢中心台北」限定的快龍絨毛布偶、胖丁絨毛布偶已全數完售，詳細進貨時間未定；不過依照日本寶可夢中心狀況，限定玩偶皆會「常態性」不定期進貨，想要購買的寶可夢玩家不用擔心缺貨。

「寶可夢中心台北」開幕首日出現不少亂象，除了出現阿公、阿嬤「資深代排團」卡位，網路也出現號稱擁有多張開幕特典卡而漫天叫價，事後傳出官方特典卡備貨充足、會對卡片貨量進行調控、發送活動更持續至明（2024）年1月2日，但17日新光三越信義新天地就公告特典卡已全數發送完畢，讓粉絲非常錯愕。