立法院院長須掌握議程的進行，可以隨時在議程中喊停；院會最重要的議程是程序委員會處理，但該院會議程是由立院院長底下秘書處編的；是否協助朝野協商讓雙方達成共識，或置之不理直接表決。另外依立法院職權行使法第6條規定，會議決議表決時，若贊成、反對同樣票數，就由會議主席決定，在3黨皆未在國會取得壓倒性優勢的狀況下，立院龍頭更顯重要性。

立法院長在黨團協商也扮演協調角色，能主動召集或由各黨團請求召開協商，各委員會審查議案發生爭議時，主席得裁決進行協商。黨團協商會議，由院長、副院長及各黨團負責人或黨鞭出席參加，由院長主持，原則上於每週三舉行。國民黨王金平曾連任5屆立法院長、任期長達17年，多次解決藍綠歧見，是史上任職最久的立法院長，被外界封為「喬王」。

從2008年第7屆立委選舉改為單一選區兩票制至今，立法院長都是由不分區立委擔任，但並非法定規則，目前也沒有立法院長罷免的相關規定；不過立法院長、副院長當選後可以改選，但必須要有全體立法委員1/3以上人數提議改選，且出席委員2/3以上人數通過才能改選。

藍營為拉攏民眾黨8席關鍵少數，提出江啟臣願意將副院長優先給民眾黨推出的人選，促成在野大團結，但其實副院長的重要性相對較低，過去重要議程皆是由院長主持，尚毅夫更直言「副院長從頭到尾上不了主持台，發出朝野協商是院長室發，不是副院長發」；立法院長、副院長照例不用質詢與表決（法律上並未規定），小黨若當副院長，形同實質席次減少，對監督政府不利。