民眾黨在麥寮鄉長補選推派推台北醫學大學細胞及分子生物研究所碩士林宜豊，至於虎尾鎮長補選，柯文哲則表態支持無黨籍的鎮代會主席林嘉弘。不過蔡壁如在3月底卻為無黨籍虎尾鎮長候選人黃美瑤站台，與柯文哲支持的人選不同，也引發外界猜測2人是否不和。

柯文哲昨天（5日）南下輔選，他先到大甲鎮瀾宮參拜，蔡壁如在等待柯文哲的期間，與台中市黨部主委江和樹聊天，江和樹詢問蔡壁如「壁如姊今天有去六輕嗎」，蔡壁如則回應「就你們祕書長（周榆修）下命令，說嚴禁蔡壁如去麥寮啊」，由於江和樹剛好在開直播，雙方對話也意外曝光。

柯文哲今日（6日）被問及此事，表示「這一定是誤會」，稱全黨去支持一個候選人都不夠了，怎麼可能會要求誰不要出現，柯文哲解釋，一開始民眾黨在虎尾鎮長補選沒有提名人，後來內部討論，認為跟林嘉弘過去有互動、較為熟識，所以支持林嘉弘。

柯文哲說明，黨中央沒決策前是個人行為，黨中央決定後就應跟隨黨中央，相信蔡壁如不會再跟黃美瑤站台。而民眾黨祕書長周榆修面對媒體詢問此事，回應「沒有啦，沒有，剛剛主席已經講了很清楚，這是從來沒有的事情」，說明一切以黨中央決定為主，全力支持林嘉弘。