陳佩琪於臉書貼文表示，「從前人家問我什麼時候退休，我都說還早哩，如今會決定提早離開，不是什麼人生規劃，就只是個人的醫療專業和行政能力現在已不符合北市衛生局的要求」，但她也強調她的專業領域還是很能夠勝任的，也很符合聯醫的要求，不過因衛生局要求的能力不足只好先行走人，她表示目前手續都核准且進行中，就等退休日子來臨。

陳佩琪表示已在聯醫服務36年，現職是院區底下院外門診部的一個小主任，診的編制只有醫師一名，而中正門診部目前就只有她一人，護理師都還是報備支援來的，門診部類似診所，就一名醫師編制，沒有藥局、沒有醫檢部門，以前主要是幼童施打疫苗和看病為主，也兼看診大人一些尋常疾病和施打大人疫苗。

陳佩琪指出，因小兒科醫師熟悉疫苗，所以很多行政區的院外門診部的主任都是小兒科醫師在擔任，這幾年施打非常多的新冠肺炎、流感、肺炎鏈球菌等疫苗，擔負起了很多台北市的公衛任務。而最近因衛生局要求院外門診部做成人健檢、老人健檢、代謝症候群、BC肝檢測、口腔癌篩檢和失智症評估，身為門診部的唯一成員，她為了要取得做這些業務的資格，規定該上的課都去上了，也拿到該拿的證照，但臨床上還是極為窒礙難行，像門診部無放射線儀器，無法做成人X光片、骨密度、髖關節和腹部超音波，而抽血、驗尿、心智評估也都需要院方支援，但她認為現在每家醫院都人力吃緊，勞師動眾到處拜託人家，實在不好意思。

陳佩琪感嘆，「我已經努力做到衛生局的期待了，現在做不下去只好自己滾蛋」，雖然自己決定離去，但她還是要為同仁請命，「官員很優秀才能當官這我知道，但也請要給基層工作人員一絲絲的尊重」；最後她也感謝和平婦幼院區院長許家禎、副院長施世亮，以及和各科前來支援的同事們，在她長達36年醫師生涯且生涯最難熬的時刻給予最大的幫助。