立法院會5月28日三讀修正條文，相關函文昨（5日）送抵行政院，行政院提出7點理由認定上述條文窒礙難行，包括，一、沒有實質討論，違反民主原則；二、混淆雙首長制，質詢總統違憲；三、無差別調查民眾，聽證範圍過廣；四、漠視正當法律程序，違反程序正義；五、無期限審查人事同意權，空轉政府重要職缺；六、「藐視國會」定義不明，恣意擴大立院職權；七、「懷疑」官員虛偽陳述，即可課刑責。行政院今（6日）通過覆議案，將呈請總統核可後，移請立法院覆議。

總統府發言人郭雅慧說明，依照《憲法》增修條文，行政院對於立法院決議之法律案、預算案或條約案，認為有窒礙難行時，經總統核可後，可以在決議案送達行政院10日內，移請立法院覆議。

郭雅慧提到，國會是民主的象徵，然而此次《立法院職權行使法》修法過程引發社會各界關注，總統賴清德必會以國家發展與民主價值全盤並審慎考量，肩負起民主憲政守護者的責任。