賴士葆今（28日）在臉書粉專發文表示，教育部次長葉丙成多次提及樂見兩岸學術交流，這點值得肯定，但與陸委會官員一併提出若干考量，像是去年只與大學生交流，今年首度安排去中山女中參訪，鑒於學生都是未成年且有家長當監護人，又在段考期間，因此善意提醒參訪不要影響上課教學，以免家長有意見。

而根據馬辦表示，他們本來希望與中國大學生交流，但鑑於官方的態度且迫於審查時間的迫近，只好作罷，賴士葆認為在討論的過程中，他確實有聽到官員提及「學生心智未成熟」，馬英九基金會執行長蕭旭岑也公開承認此事，只是當初討論聲音有點吵雜，讓他誤以為是葉丙成所講，昨（27日）已與葉丙成通話並取得諒解。

賴士葆批評，教育部長並沒有在協調會現場，「卻越俎代庖斥責本人，實深表遺憾」，教育部口口聲聲說要開放兩岸學術交流，但經過這次協調會，賴士葆發現似乎有不少政府單位，為了迎合賴政府的抗中政策，「而常常予以申請單位穿小鞋」。最後，賴士葆盼望教育部秉持學術歸於學術的原則，去除政治的干預推動兩岸交流。