昨（29日）晚在羈押庭，法官問柯文哲身為民眾黨主席，如何避面和被告、證人（如黨員）有串供滅證疑慮，柯文哲稱9月就想辭黨主席，因為不辭整個黨務無法運作，「因此要請黃國昌來幫忙」，原本旁聽的黃國昌突然大步離席，事後面對接黨主席一事一律不回應，僅回應會努力營救柯。

面對黨主席接班問題，民眾黨立委林國成則表示，柯文哲沒有欽點黃國昌，只是先請他來幫忙，而非所謂代理黨主席，林國成指出，一切要依程序、經中央委員會同意，強調「黨有黨的規矩」，林國成也提到，目前黨中央緊急應變小組有3位召集人，其中之一就是黃國昌，大家各自分工、目前運作順暢。

今民眾黨立委吳春城也澄清，指柯文哲的意思是要請黃國昌幫忙處理黨務並非直接代理，若依黨內程序，主席請辭後要透過黨員直選，目前經多數中央委員交換意見後，一致認為主席問題還要再討論，是不是要挽留也需進一步討論。

此外，黃國昌今則批評北檢，稱檢方昨晚在延押庭的意圖明顯，「要不然繼續羈押、要不然把黨主席辭掉」；民眾黨立委黃珊珊今也在臉書提出相似論點，質疑北檢以逼柯文哲辭黨主席為目的。