罷免團體「剷除黑芯」指控，罷免徐巧芯的連署送件不到2天，和團隊合作的友善店家遭到北市府各局處密集稽查，有4間店家連續被多個單位稽查，像是衛生局、環保局、消防局、建管處等，在12到14日間前往相關店家，更有警員到場，還有店家接到文化局「致電關心」。

罷團批評，稽查如此密集，而且沒有事先通知，店家難免會產生壓力，這麼不尋常的行動強度，讓人不禁感到疑惑。罷團進一步表示，他們理解市府為了維護市民安全，有定期稽查的必要，但是在多數情況下，會事先行文通知店家，但店家卻在毫無準備的情況下，面臨稽查，不僅營運受到干擾，也讓人感到不安，讓業者擔心是否會受到不當對待。

另外，罷團指出，檢舉和稽查內容有讓人難以理解之處，像是店家只販售飲料，卻被檢舉油品處理不當；沒有聘請員工，卻被檢舉違反《勞基法》等情況，希望相關單位可以做說明，以免業者無端受到影響，最後罷團表示，他們不會退縮，呼籲蔣萬安和徐巧芯兼顧程序透明與合理執法。

台北市環保局對此發表聲明，表示秉持依法行政、一視同仁，並依法執勤，相關報導不符事實且張冠李戴。環保局也表示，受理民眾陳情案件是政府職責，同仁依法查處、還原事實。台北市長蔣萬安今（17日）下午受訪表示，各局處都有澄清，對於相關說法，環保局也嚴正駁斥，並譴責不實指控。