今年中台灣新冠肺炎疫情爆發，中央疫情指揮中心在5處來往澎湖、金門、馬祖等離島機場設置篩檢站，6月2日起提供旅客篩檢服務，搭機時無症狀，但過去14天有疑似症狀的旅客，都可在機場篩檢站進行快篩，旅客也可自願篩檢。

民航局表示，目前疫情已經趨緩，澎湖縣、金門縣及連江縣等離島縣市，也已經取消旅客抵達的強制篩檢，指揮中心經過評估後，決定暫停松山、台中、嘉義、台南及高雄機場篩檢站運作。如有疑似症狀的旅客請勿搭機，應儘速到醫院進行必要採檢。

雖無強制進行篩檢，旅客仍需填寫健康聲明書，由保全人員初步檢視，如旅客有相關症狀，將詢問旅客是否需要就醫採檢，另外，業者於收回健康聲明書與檢查旅客狀況，發現有症狀的旅客應限制搭機。民航局表示，未來防疫措施，將配合指揮中心做滾動式調整。