根據中央選舉委員會第609次委員會議紀錄指出，基隆市選舉委員會辦理市長謝國樑罷免案存有缺失，第一是中選會到基隆市選委會慰問及視察的公文，被外流給媒體，遭炒作成中央介入地方，影響選務機關公正形象。

第二，提議人名冊查對方面，經過基隆選委會認定有偽造情事，刪除者達557人，其中有319人是多張提議人名冊基本資料及戶籍地址筆跡相同，雖然提議人簽名筆跡不同或蓋章，仍被認為是偽造，或是單張提議人名冊基本資料、戶籍地址筆跡與簽名不同，仍列偽造，占刪除人數的55.29％，而且沒有寄送查詢單詢問，違反中選會函釋規定。

第三，連署人名冊收件以少數違例情形不受理，而且無視中選會現場督導人員說明，執意開具不予受理函；第四，針對連署人名冊查對期限及寄送查詢單未獲回覆處理，無視中選會6月13日協調會議決議及5月23日函釋規定；第五，違反選務機關專業標準，在連署人名冊查對階段，提出2.5萬份查詢單郵資需求，占罷免案連署人名冊人數58％，影響選務機關專業形象。

第六，中選會接到檢舉，連署人名冊查對過程中，有主管要求工作人員違反規定寄發查詢單；第七，罷免案程序進行時，違反選務中立及行政中立立場，隨意對外發言，導致媒體猜測選務機關中立立場；第八，罷免案投票日前，提供錯誤罷免通過票數門檻資訊給媒體；第九，罷免案投票當日，在結果出來前有媒體引述基隆選委會提供粗估投票率，影響選務機關中立形象。