國防部法律司長沈世偉中將說明，自民國102年《軍事審判法》修法後，軍法案件自同年8月起分兩階段全面移由司法機關辦理，只剩戰時審判軍人犯罪的功能。改制後11年間，國防部透由內部訓練，借調軍法官至檢察署擔任檢察事務官等方式，希望保存戰時審判的運作種能，但效果非常有限。經通盤檢討，國防部為維持一個平時正常運作的軍法系統，才能落實軍事審判平戰轉換運作順遂，發揮嚴肅軍紀、保障人權的功能。
沈世偉坦言，過去社會各界都對軍事審判有諸多詬病和質疑，如軍事審判採階級管轄、欠缺獨立性等疑慮，國防部都虛心接受。所以這次修法將全盤檢討調整，確保軍審制度重啟後符合公平審判原則及正當法律程序的憲法要求，並兼顧人權保障與軍隊紀律，強化國家安全。
沈世偉說明，這次修法有5大重點，第一「軍事審判案件限於軍人職務上犯罪為主」，未來現役軍人平時觸犯陸海空軍刑法第二編有關之軍事犯罪（如違反效忠國家職責罪章等），將受軍事審判；第三編軍人一般犯罪案件，規劃仍由司法機關辦理。
第二，「制定軍事法院組織法、軍事檢察署組織法」，依國防部組織法規定得視部隊任務需要，於適當地區設軍事法院、軍事檢察署，並依「國防部各級軍事法院組織準則」運作，為提升機關之獨立性，將另行研訂軍事法院組織法、軍事檢察署組織法，以杜外界藉由機關調整干預偵審的疑慮。
第三，「制定軍法官人事條例」，現行國軍任官、任職、服役等規範，並未針對軍法官有特別規定，相較於法官法對於從事審判者應有的制度性保障，明顯不足。未來國軍將參考法官法制度精神，對於軍法官任免、遷調及評鑑、淘汰等，將研訂「軍法官人事條例」，有別於一般軍人人事制度，以確保公正獨立。
第四，「從事偵審之軍法官必須具備軍事歷練」，因軍法案件涉及軍事專業特殊性，擔任軍事院檢軍法官具備一定部隊服役經驗或資歷，才能正確掌握軍法案件特性，未來將律定從事軍事偵審工作的軍法官，必須具備一定部隊服務資歷，才能參加甄選。
第五，「在符合公平審判原則、正當法律程序下，通盤檢討修正《軍事審判法》」，除研議採行全面強制辯護、廢除階級管轄等，有關事實審及法律審的救濟、審級制度設計，將徵詢司法機關、專家學者意見妥適規劃，並與社會妥善溝通，爭取國人支持。
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