國民黨「同舟計畫」專案，是中國國民黨黨員回娘家特別辦法。國民黨黨務高層表示，「同舟計畫」是採通案式處理方案，針對過去加入親民黨、新黨與民眾黨，認同國民黨理念的黨員，都可回來共同打拚，因此與傅崐萁回黨一案無關。

對於傅崐萁是否回黨，國民黨高層稱「還不知道」，因為回黨是個人決定及權利；至於傅崐萁重返國民黨可能擔任副主席等黨職，也必須要擔任過中評委或中央委員才有資格，但傅崐萁並不符資格。

國民黨高層說，傅崐萁申請恢復黨籍案已過了懲處期限，即便沒有「同舟計畫」，根據國民黨規定，凡過去因開除、撤銷黨籍等考紀處分而離開國民黨的黨員，要再回到國民黨，必須經由考紀程序。

也就是說，傅崐萁要回國民黨，仍須經地方考紀會與中央考紀會兩級審核通過；而只要符合相關規定申請回黨，就沒有理由阻擋黨員的合法權益。「同舟計畫」應只能適用於自行退黨或失聯黨員。