根據指揮中心公布的各年齡疫苗覆蓋率，18至29歲的第一劑覆蓋率最高，達到92%，最低則是75歲以上長者，覆蓋率為73%。不過該數據是以「（本國籍接種人數+外籍人士施打數）/內政部戶政司全球資訊網人口統計我國人口數*100」得出，外籍人數人士並未包含在分母中，計算方式引發爭議。

對此莊人祥25日說明，目前對外報告的例行資料，包括每日接種人數等，都是加上外籍人士做計算，而覆蓋率的分母，則是維持內政部公布的我國戶籍人口數。莊人祥強調，指揮中心每天都以是否加上外籍人士，計算出兩套數據，內部也都有在參考，要公布隨時可以公布。

莊人祥表示，由於一開始就以每天的接種量，除以內政部公布的人口數，疫苗覆蓋率一直都是這樣計算，沿用到現在也是考量一致性，且內政部公布的人口數中，也有一部分民眾僑居海外，回國後即便有施打疫苗，也不會加到分子中，一來一往數據差不多，誤差不到3%。