柯文哲14日在廣播節目《千秋萬事》接受王淺秋訪問，王淺秋先說到，指揮中心與柯文哲在防疫政策上有衝突時，似乎都吵不太過柯文哲，對此柯文哲直言：「這就是我的本業，兔子不要跟烏龜比游泳！」接著也說到指揮中心「後面那排」都是自己的同事，然而難以理解目前他們所做出的決策，還形容「真奇怪！」、「怎麼會這樣？」

至於中研院爆發實驗人員感染，柯文哲認為2.5億個案例中只有3件是被動物咬到，因此不應該先猜源頭來自於此，還強調「醫學是統計的科學」。柯文哲也說到，2003年台大醫院急診處關閉就是因為吃飯時造成感染，因此一開始就研判應為內部污染才造成中研院的事件。另外，感染實驗室人員只做了5個月離職，柯文哲也認為訓練人員不易、管理不良。

不過王淺秋提到，即便柯文哲基於專業而做出應該不是動物傳給人的判斷，但指揮中心仍在第一時間「打你一下」，出現意見相左的情形。對此，柯文哲則說指揮中心的人「跟我同一個、同一批老師教出來」，判斷卻有所不同，因此認為「這就是政治凌駕專業」。而被問到對陳時中的看法，柯文哲批評陳時中本來就沒有專業，後面則更正說法：「這不是他的專業。」

至於國產疫苗政策，柯文哲坦言「很明顯一開始就知道拿不到美國FDA（認證）」，並舉例後來研發出的疫苗，包含美國與德國的BNT、英國的AZ、美國的莫德納、俄國的衛星-V、中國的科興與國藥，而這些研發國家便是「世界五強」，才會認為研發疫苗「哪是你（台灣）可以玩的？連日本都不敢玩了！」柯文哲也透露，當時就知道衛福部發了20億元給4間國產生技公司、每1間拿到5億元，即便如此他仍認為：「再加2個零都做不到！」還說這些公司錢也賺夠了、該賺的都賺到了。

最後柯文哲再批評國內疫苗計畫，包含雖然花了8,400億元採購疫苗，然而最終「送的比買的多」，甚至13日開會才知道有一批莫德納疫苗已經過期而報廢，歸咎原因在於中央一開始採購時完全沒有計畫，如第1劑打完之後要間隔多久等等。

台北市衛生局專門委員歐佳齡說明，過期報廢的是指12月7日過期的那批莫德納疫苗，台北市有用完，甚至也幫忙外縣市消化屆期疫苗。柯文哲15日中午至台北市議會提及此事，除了強調疫苗放到過期「哪是我們的問題」，也預計於下午召開記者會說明。