台北市長柯文哲妻子陳佩琪於臉書撰文，提到她所服務的臺北市立聯合醫院接獲上級指示，需多打高端疫苗，質疑當初採購的500萬劑現仍有279萬劑，若過期報廢，政府損失恐多達30多億元等，質問為何不能分批採購？
7日下午的中央流行疫情記者會上，媒體提問各廠牌疫苗庫存數量，及有多少數量的疫苗即將於3月到期，指揮官陳時中回應，莫德納疫苗存貨約150萬劑、AZ和高端約250萬劑、BNT剩約71萬劑，其中只有AZ接種量低到需要擔心打不完。高端部分，陳時中強調：「這都是有零星的，那不會有大量銷毀的情況。」
至於3月底有多少疫苗到期？陳時中計算後指出，整體來說不多，「解凍後的效期中裡面，（3月）莫德納大概沒有問題，AZ像我剛剛講過可能有打不完的一些情況。」BNT全數到3月23日屆效，高端直到4月19日才有到期情況，接下來就是4月22日、6月3日，其中6月3日到期的有28萬多劑，以目前一天接種3,000至5,000劑高端疫苗速度，6月底基本上可打完。
疫情指揮中心否認外界質疑的大量報廢，並預告8至11月會再陸續分批交貨。若其他國家提出需求，台灣將捐贈AZ疫苗，並再次強調，高端短期內沒有大量銷毀問題，若國外有需要也可提供高端疫苗。
陳時中表示，現在各界都非常關心新冠疫苗是否過期，會儘量在疫苗效期內做最大化運用，若疫苗過期也一定會銷毀，不會讓民眾接種過期貨。並強調超額準備疫苗有其必要性，「現在這樣做，未來也會這樣做」。
