歐盟執委會於2021年12月21日宣布台灣加入「歐盟數位新冠證明」系統。歐盟數位新冠證明為世界性標準之一，國際成員國多且最早用於國際旅行，為使我國民眾能加速入境歐盟等國家，指揮中心於同月28日開放我國「數位新冠病毒健康證明」供國人下載使用。

另自今年1月21日起，民眾前往部分休閒娛樂場所需配合出示完整接種COVID-19疫苗紀錄，除出示「紙本疫苗接種卡」外，亦可使用「健保快易通」或「數位新冠病毒健康證明」提供檢視。 「歐盟數位新冠證明」原本規定基礎劑(1、2劑)的效期是270天，因現在開放12歲以上可接種第3劑，歐盟執委會考量不是所有國家都開放施打，因此將基礎劑僅限於18歲(含)以上有效期限為270天，未滿18歲的民眾所持證明基礎劑有效期限為365天，並希望各EU-DCC成員國配合修改各國查驗程式。

指揮中心配合此政策，宣布我國「數位新冠病毒健康證明查驗程式」於13日改版，莊人祥在疫情記者會上表示，該修正不會影響已核發的數位證明，不需要重新下載，系統會自動判斷，未滿18歲的青少年所持證明基礎劑有效期限為365天。

莊人祥說明「數位新冠病毒健康證明查驗程式」，未滿18歲青少年已接種2劑疫苗，但超過365天效期時，系統會呈現紅色「不通過」字樣，接種2劑疫苗且未滿14天者，則會顯示黃色「非有效期內」。

數位新冠病毒健康證明查驗程式說明。（中央流行疫情指揮中心提供）

指揮中心提醒，由於必須配合歐盟資料更正，各場所使用查驗程式，可透過重新連線至查驗程式網站，並清除使用者端的快取記憶，以利保持最新驗證邏輯。