台北市衛生局指出，此次依類別檢驗指標性病源菌，像是沙門氏菌、腸桿菌科、大腸桿菌等，初抽結果有20件不符規定，經通知業者限期改善，複抽結果仍有3件產品不符規定，手搖飲店「波囍」的「經典紅韻」以及「龜記」北投石牌店的「紅水烏龍」、「三韻紅萱」，多被驗出大腸桿菌、大腸桿菌群超標，依違犯《食品安全衛生管理法》，將兩家業者分別裁罰3萬、4萬元。

台北市衛生局表示，指標性病源菌被用來作為監測水、飲冰品及食品衛生指標之一，或是製程有無衛生缺失的重要指標之一。如超過標準，表示在製作過程當中的衛生狀況、食材、器具及包裝過程可能遭受污染，或工作人員的個人衛生狀況不佳所造成，至於常溫保存更是微生物繁殖的最佳環境，過高的指標性病源菌會進而影響飲冰品品質及減少其保存期限。

台北市衛生局提醒，業者應從四大重點進行衛生管理，一、在販售及製造場所應保持清潔、定期清潔與消毒及注意冰箱儲存溫度管控，二、「作業人員」應重視個人衛生做好定期體檢，注重手部清潔消毒，若有傷口則需妥適包紮處理，並戴上不透水手套，三、應確認冰塊或配料供應商之製作過程及衛生條件及保留進貨紀錄或資料，四、應慎選濾水器及濾芯來源並定期更換製冰機或飲水機濾心等。