對於酒駕指控，林冠年在臉書澄清，過去因疲勞駕駛擦撞路邊車輛，已與對方和解，對當事人深感抱歉，並表示此為有心人士匿名造謠抹黑，打擊他與民眾黨新竹市長參選人高虹安。

民眾黨今年初恰好處理議員參選人涉酒駕案件，嚴格規定涉酒駕等嚴重行為者不予提名、公職人員酒駕一律開除黨籍等，因此3日接獲檢舉後便火速處理。民眾黨表示，選舉決策會查明林冠年酒駕相關事證明確，違反黨規，依黨規應撤銷其竹北市長提名資格，該決議已送交臨時中央委員會後，4日通過後生效，並送交中央評議委員會後，決議開除黨籍。

對手林為洲表示，立法院上一會期才三讀通過「交通管理處罰條例」加重酒駕者的刑罰，目的就是要遏止酒駕事件的發生，並指出酒駕零容忍已成全民共識。林為洲勸戒，既然已經發生「（林冠年）也應知所進退，給選民與國民一個交代」，更指民眾黨中央此次火速開鍘林冠年黨籍「確實讓人敬佩」。

不過林冠年對於涉嫌酒駕喊冤，指出是因疲勞駕駛所致，才會不認擦撞其他車輛，但事故中並未有人受傷，林冠年也稱已經與對方達成和解，咬死是政治迫害；新竹縣警方則將在稍後對外說明案情。

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