漁業署21日發函給台北市產發局，表示由於中華民國全國漁會、高雄市興達港區漁會，將無法繼續供應台北市石斑魚，28日起暫停供貨，且恢復供應時間未定，產發局23日也發函台北市教育局要求緊急應變。

台北市教育局在28日發函給各校，通知「行政院補助學校午餐採用國產可溯源石斑魚專案計畫，即日起暫緩供貨」，並提到各校原排定供應石斑魚日期，請學校或午餐廠商先行調整菜單因應，待中央通知恢復供貨後再行安排供應。

原先營養午餐中若有菜色是石斑魚，為避免出現雙主菜之情形，會將原本主菜換成豆漿或牛奶，特別調整成「石斑魚菜單」。不過台北市教育局副局長陳素慧指出，28日已經發函給各校，由各校告知營養午餐的團膳廠商，緊急替換先前已排好的「石斑魚菜單」。

陳素慧也表示，目前石斑魚恢復供貨時間未定，就不會再特別另排石斑魚菜單，而台北市的學校都已經吃過第一輪的石斑魚，等到農委會通知恢復正常供應，就會安排第二輪給學生吃，依照石斑魚到貨時間直接上菜，當成意外的加菜驚喜。