修行氣功的「法輪功」團體自1994年發跡，逐漸從運動發展成有規模的宗教，吸引海內外眾多信徒，中國當局越發重視；1999年，法輪功成員不滿長期被警察騷擾，1萬多名信徒聚集抗議，《衛報》等外媒報導指出，這是自1989年六四天安門事件以來，中國最大規模的示威抗議，後被稱為「四二五上訪」，據悉江澤民震怒不已，直指背後有境外勢力，下令鐵腕鎮壓，稱「法輪功必須被消滅」，當時被軟禁的趙紫陽2度寫信反對，中共其他高層對此決定亦有微詞，但江沒理會。
而滅絕手段，除了政治宣傳、監禁、強制思想改造，外界也指控他們使用強迫勞動、濫用精神藥物、毆打等非人道酷刑，更有調查報告稱，中國政府大規模、系統性活體摘取包含法輪功等良心犯的器官謀利，數萬人喪命。
儘管中國始終否認相關指控，不過法輪功境外成員仍積極聲援，提起幾十起國際人權訴訟，少數有動靜的，是2009年底，西班牙國家法院、阿根廷聯邦法庭以群體滅絕罪和反人類罪起訴了江澤民、薄熙來、秘密警察「六一○辦公室」前負責人羅幹等5名高官，阿根廷甚至發出拘捕令，不過此舉象徵意義大於實質意義，因為只要江澤民不入境阿根廷或與阿根廷簽有引渡協議的國家，就不會被捕。
前領袖被通緝終究難看，中共外交部在沉默幾天後回應，稱外國法庭做出支持邪教的裁決，將影響雙邊關係，並且明確要求阿根廷政府「妥善處理這件事」，最後訴訟也不了了之。
《法新社》評論指出，江澤民不理會外國批評，甚至曾援引愛因斯坦的相對論辯護，稱民主是一個相對的概念，堅持中國會按照自己的步調前進。然而大力將愛因斯坦引進中國的物理學家許良英指出，相對論強調絕對性，即物理定律和光速在所有觀察者眼中都是不變的，而「民主和自由就是絕對的」。
香港《前哨月刊》2011年18大前刊出一篇「江澤民終生後悔的兩大事件」，作者「嚴大明」宣稱，江對1999年中國為表對南斯拉夫的支持，拒絕撤大使館，結果導致使館內10多名外交人員被北約炸死感到懊悔；另一事就是鎮壓法輪功，為他樹敵萬千。
外界對這篇文章的真實性始終抱持疑問，有人認為是嚴某真的從江的親信口中獲知內情，有人認為是江澤民自己寫的，假託嚴某之名發表，為得是製造他幡然醒悟的假象，避免妻兒日後被清算，亦有人認為通篇都是假的。直至江澤民過世，都沒有對這篇社論的真實性發表任何看法。
