東京醫科大學2018年被揭發伴隨著性別歧視的黑箱入學考，校方自2011年開始，在考試過程中會自動扣女考生分數，藉此來抑制女性錄取率，也導致無數女性考生在不知情的情況下落榜。更誇張的是，通過一階筆試的男考生，將會在第二階段口試中自動被加分，自此之後，女性考生錄取率未再超過男性。

以2018年為例，有1,596位男生報考，最後有141人考上，男性錄取率為8.8%；而1,018個女生報考，僅30人被錄取，女性錄取率惟2.9%，男性考生在這次入學榜單上佔了8成5，錄取比例相當懸殊。事實上，只要仔細查看過去幾年的錄取率就能略窺一二，女性合格率從2010年的10%忽然驟降至2011年的4％，並在往後的7年間都未曾再超過6％以上。

在事件爆發後，校方辯解的理由竟是，女學生畢業後即使投入相關職場，很可能會因為結婚、生育等因素離職，間接造成醫院人力不足，因此直接從入學源頭大刀斬斷女性考生人數。就有相關人士透露，這種作為是為了抑制女性醫師所採取的「必然之惡」，將女學生人數控管在全體學生的3成以下是「學校不必明言的默契」。

東京醫科大學的名譽也隨著醜聞一落千丈，16名曾報考東京醫科大學的女性憤而向校方提告，聯合求償1億1,344萬日圓（約新台幣2,534萬元）。2022年9月，東京地方法院一審判賠1,826萬日圓（約新台幣407萬元），考生們認為賠償金額太低，決定再上訴。

而東京最高法院在5月30日推翻一審判決，決定提高其中4名女考生的賠償金額，高等法院認為，這4名女考生本來的分數可望錄取，但被學校惡意操控成績，以致落榜，這造成考生們極大精神損害，因此將4人賠償金從單人最高150萬日圓（約新台幣33萬元），提高到最高300萬日圓（約新台幣67萬元），最終總賠償金為2,085萬日圓（約新台幣465萬元）。