侯友宜先前在總統候選人電視辯論會表示，他有能力籌組聯合政府，也要號召一場「新台灣政治改革運動」，核心價值是和平、尊嚴、公平正義與清廉勤政，他相信民眾黨總統候選人柯文哲會扮演重要角色。但遭柯文哲反彈，懷疑不是合作，而是要操作棄保。

侯友宜在網路節目《董事長開講》直播談到，去年11月藍白兩黨協商總統正副人選階段，曾在前總統馬英九介入協商下，簽署藍白合6點協議，最後一點承諾「為台灣第三波民主改革建立典範，必須成立聯合政府，民眾黨主責監督制衡，國民黨主責建設發展」。侯強調，第三波民主改革是為了建立典範，是重要里程碑，要讓人民重新信任政府，領導人要有誠信，建立典範就是為了團結大家。

侯友宜表示，當時藍白合6點協議，別人算不算，他不管，但是他講過的一定算，且強調協議是柯文哲跟他簽署的，不是黃珊珊，聯合政府勢在必行，強調會用人唯才，適才適所，團結所有黨派與最優秀的人才。