台大醫院工會指出，選舉投票日早於去年3月10日公告，台大醫院有足足將近一年時間，針對全院同仁的投票意願及戶籍所在地做足詳盡調查，再依據調查結果加以協調排定1月分班表，讓同仁得以返鄉投票；但台大醫院非但沒有在事前做系統性的全院普查，在12月院內發布投票當日的出勤規定後，單位主管也沒有主動彙整上述資訊以預排人力，導致醫護協調困難，犧牲投票權利。
對於醫護反映找代班困難一事，根據《聯合新聞網》報導，台大醫院發言人陳慧玲表示「相關排班投票，院內各單位主管都有安排協調，不宜在選前多提這件事，就不繼續回答」，並稱「這不是第一次投票了，台大醫院不希望在選前有爭議出現」，不願意再回答相關問題。
台大醫院企業工會秘書長邱宇弘表示，公職醫事人員依據現行法令及函釋規定，輪班公務員若於投票當日出勤，不僅無法領取加班費、補休或任何其他補償，以台大醫院現行規定而言，公職醫護甚至還要用原有休假時數「請假」才能前往投票，等於是變相阻撓行使投票權。他透露台大全院約1.2萬名員工，以三班制來看，週六輪值白班的醫事人員估算落在500至600人左右。
