陳佩琪7日晚間在臉書發文，表示在聯合醫院服務36年，如今會決定提早離開，不是什麼人生規劃，就只是「個人的醫療專業和行政能力現在已不符合北市衛生局的要求」，不過她同時強調，自己的專業領域還是很能夠勝任的，也很符合聯醫的要求，但因衛生局要求的能力不足，只好先行走人，她表示目前手續都核准且進行中，就等退休的日子來臨。

陳佩琪表示，現職院外門診部的編制就只有她一人，護理師是支援的，沒有藥局或醫檢部門，卻得做成人健檢、口腔癌篩檢和失智症評估等項目，還會被衛生局要求業績，她認為衛生局想在院外門診部執行這些業務不是不行，但理應派人支援，而不是要她一人去想辦法。

陳佩琪感嘆，「我已經努力做到衛生局的期待了，現在做不下去只好自己滾蛋」，雖然決定離開，但她還是要為同仁請命，「官員很優秀才能當官這我知道，但也請要給基層工作人員一絲絲的尊重」。對於陳佩琪申請提早退休，台北市立聯合醫院回應，事件涉及醫師個人的生涯規劃，尊重其個人規劃。