立法院28日三讀通過《職權行使法修正草案》，賦予國會調查權及聽證權，對此，監察院隨即發出聲明，表示部分條文已影響監察核心職能，涉違反權力分立，監察院無法接受，各界也應審慎嚴肅以對。

傅崐萁則開嗆「一定會廢除監察院」，並表示「中華民國就應該是三權分立的政府，才能夠趕上世界整體民主潮流，這些冗員，酬庸養肥貓的地方早就該廢除，從現在開始，啟動查弊的行列就會馬上進行」，傅還說會在最短時間內成立藍白在野的特偵組，全面查弊，務必讓陽光照進台灣，腐敗政權得到制衡。

柯文哲29日出席民眾黨中央委員會時被問及此議題，表示自先前大選期間民眾黨就持反對態度，柯認為法律應該有一致性、公平性，「沒有說大官就要另外一群人來辦，等於在告訴老百姓有些大官是辦不了的，要特別去辦大官，我個人反對司法沒有一致性，司法應當公平，被每個人信任，所以台灣民眾黨反對特偵組」。