賀軍翔住家於5月24日突遭檢警搜索，傳出是被女子提告妨害性自主，當時台北地檢署以「保全證據」為由，指揮警方前往他的住家搜索，並查扣手機等相關證據，但未傳、拘相關人員。
賀軍翔2日首度被傳喚，赴台北地檢署說明，他一抵達時隨即被大批媒體包圍，有媒體提問是否有對女子有「不禮貌」行為，但賀軍翔不發一語，逕自通過安檢門進入北檢。
事實上，爆出涉嫌妨害性自主後，賀軍翔曾發出聲明，強調「並未與任何第三人有任何踰矩行為」，因檢警偵辦案件需要通聯紀錄，才會取走他的手機，進一步釐清案情，他強調會全程配合。
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