根據《鏡週刊》報導，勤益科大的校長陳文淵被校內人士指控，護航愛女陳怡菁謀職。今年4月勤益公告，要招聘一名具有「數位音樂」專長的專案教授，據悉陳怡菁並不具備教育部部頒助理教授資格，但陳文淵仍以酬庸方式，護航女兒謀取教職。另，陳文淵還遭控任內揮霍校務基金，蓋了一個沒有車道的停車場。

針對陳文淵護航女兒以及濫花公帑的傳聞，勤益科大今天（12日）發布聲明回應。勤益科大表示，校內教師任用皆依《教師升等與聘用辦法》，雖然陳怡菁的確有投遞職缺，但在系所的資格審查階段，所有應徵者經2次公告均無人滿足聘任條件，因此徵聘案將於下學期重新公告，「本校聘任教師的各級教評會委員，由系院校各級依法選舉產生，以確保客觀及專業需求；且查核本校113年度專任教師及專案教師名單，並無陳師（陳怡菁）」。

針對工程經費預算的相關指控，勤益指出傳聞有「諸多謬誤不實之處」，說明新校區大門工程預算，整體工程決標金額約為5,700萬元，工程期間因物價指數上漲、天候因素、配合校內大型考試及活動以及部分，變更設計項目追加工期，包含增加弱電接地、新增施作大門及西側門既有AC刨除及鋪設、新增大門路基工程、增設排水設施、西側門機車入口動線調整、大門警衛室廣場由軟底級配改為硬底級配、新增假儉草數量及減做步道磚，增設方尖碑下方碑文牌，合計該工程支出總額約為6,100萬元。

至於連接機車第三停車場機車便道，工程決標金額約為980萬元，因天候因素、配合校內大型考試及活動以及電信管路改管、通訊電纜與光纜接線測試追加工期58.5日，追加金額約28萬元，工程第一階段於2024年7月11日完工，目前基地屋頂尚在架設太陽能板，待完成後，即可進行最後階段的機車停車場一樓鋪面工程。