《總統副總統選舉罷免法》第41條明確規定，政黨推薦的候選人補貼費用，應由推薦的政黨領取，而不是候選人本人。游淑慧指出民眾黨的選票補助款共1億1071萬3980元，柯經常表示民眾黨是小黨、窮黨，「結果黨主席自己還從民眾黨的破碗中搶飯吃、挖走2／3的飯」，還拿補助款幫自己投資置產，讓她諷刺「義務反顧選一次，變成鈔票滿滿賺一次」。

民眾黨發言人李頂立在1月18日公布補助款用途時，稱主要會用在政黨維持營運的經費，包含政黨、立院黨團與地方經營等，如今柯文哲大手筆置產設立個人辦公室，民眾黨卻還沒有長久辦公室作為政黨的據點，且藍綠皆撇清從未用選舉補助款置產，讓外界對於補助款用途增添疑慮；國民黨稱總統選舉補助款皆用於黨務支出，以及支付黨工薪水，蔡英文辦公室也說基金會、卸任辦公室都是「租用」。

2024總統大選民進黨賴蕭配獲得1.6億補助款，規劃3等分使用，第一捐公益，第二提供創黨、建黨黨員生活弱勢照顧及年輕黨工出國歷練深造，第三則依照規定回捐給黨。國民黨侯趙配獲得1.4億補助款，全數捐給國民黨中央黨部，由黨中央統籌規劃。