陳啟昱2016年6月擔任台鹽董事長，隔年成立台鹽綠能，並身兼董事長，2021年2月在蘇貞昌擔任行政院長任內請辭，外界揣測和派系競爭有關，民眾黨前立委陳琬惠去年揭露陳啟昱在高雄旗山農牧地違法蓋豪宅，陳啟昱當時宣布退出民進黨，不再參與政治事務。

檢調人員懷疑，陳啟昱擔任台鹽董事長期間，公司配合政策協助種電，和光電業者共謀「以少報多」浮報工程款項，從中獲利數百萬、甚至千萬元，另外，台綠高層疑似安排自己的人手在下包的工程公司，再透過違約、給付賠償金等名目，檯面上台綠賠償金錢給廠商，其實是把錢移出來，相關手法有待進一步調查釐清。

台南檢調22日大舉搜索台鹽總部等30多處，並約談34人，接近23日凌晨5點偵訊才告一段落，經過漏夜偵訊，陳啟昱、蘇坤煌、郭姓前副總經理，以及蘇姓、戴姓兩名公司負責人涉嫌違反《證券交易法》特別背信及公務員登載不實等罪嫌，且犯嫌重大，有串供、滅證、逃亡之餘，皆向法院聲請羈押禁見。另外，戴姓被告以30萬元交保，伍姓、兩名張姓被告均以20萬元交保，陳姓、賴姓被告10萬元交保，其餘被告及證人被請回。