鄭文燦委任的3大律師，在準備程序庭聯手批起訴書純屬檢察官個人臆測，且引用的都市計畫流程錯誤，夾敘夾議帶入臆測或主觀判斷，質疑檢方辦案草率、品質粗糙。

承辦檢察官陳嘉義以16點一一反駁，指全案有起承轉合，舉證金流、行賄口供、市府會議紀錄等都非常完整，甚至給錢和退款的金流都一應俱全，並指其中「不是只有excel檔而已」引人遐想，疑似暗諷北檢偵辦柯文哲案證據不足。

陳嘉義隔天（2024年12月31日）下午在檢察官論壇致歉：「抱歉法庭上攻防言論不慎，致引發爭議。」解釋鄭文燦案事證中也有許多excel檔，聽到律師指稱本案罪證不足充滿臆測，為了反駁此一指涉，才概稱還有許多其他具體事證，不是只有excel檔，並非意在指涉與其他案件類比。並表達敬佩北檢學長姐常在機敏案件偵辦壓力下工作，再次致歉。