指揮中心表示，為了了解5月爆發本土疫情時，社區中自然感染或接種疫苗的抗體陽性比例之地理分布與趨勢變化，以及評估捐輸血者之風險，將從4月25日至7月3日，由捐血中心的血清存檔樣本中，隨機抽樣5,000件，檢測SARS-CoV-2病毒抗核蛋白及棘蛋白抗體。本次計畫不僅是防治政策的參考依據，國際上也普遍使用於COVID-19血清流行病學調查方式。

為了保護捐血人個資，血液基金會抽樣後，僅提供匿名資料及血清存檔樣本給疾管署進行檢驗與資料統計分析。血液基金會將按照程序銷毀抽樣檔案，因此血液基金會或疾管署都無法辨識或回溯捐血人的檢體檢測結果，也無法將抗體檢測結果告知捐血人。

指揮中心說明，若民眾於該段時間捐血，被抽到的機率為1至2%，相關民眾欲退出本計畫，可於10月18日前致電1922，並留下血袋號碼或提供姓名、身分證字號及生日等資料，血液基金會將於抽樣前排除相關血清樣體。