花蓮縣東里車站北上的鐵路橋梁新秀姑巒溪橋，受到9月18日地震影響，鋼筋外露受損嚴重，更出現梁柱位移電車線嚴重脫落，連軌道都彎曲變形，台鐵局預估光是修復只少得耗時1個月以上，甚至長達半年。

花蓮運務段長吳金添：「新秀姑巒溪橋，電車線桿有斷損、傾斜的大概有40根，修復的時間可能要比較長。」雙十國慶檔期，當地觀光旅遊商機恐怕因為交通受阻先泡湯，至於是否影響到春節，還得看搶修進度。

鐵路局表示，目前新秀姑巒溪橋受損最嚴重，有15支橋墩位移，橋梁位移達20到100公分，橋墩也有隆起，而新萬里溪橋和客城1號橋分別出現橋墩裂縫和橋台軌道挫屈等損害，9月27日將由專業顧問公司提出安全評估報告，再擬定搶修計畫。

但鐵路交通受阻，讓當地居民抱怨連連，當地居民：「親戚他們說現在都沒辦法坐回來，真的不知道怎麼辦，只能搭類火車，可是類火車還有造成轉車很麻煩，再來時間上絕對會耗比較多的時間。」

對此台鐵採用類火車，公路接駁模式，原本整點一班，現在每30分鐘1班，並視現場情況機動加開班次，縮短旅客等候時間。也預計9月底前，北邊可以通車到玉里，往南也能通車到富里，而玉里到富里間約18.8公里，會採公路接駁。

消基會交通組召集人李克聰：「交通會產生極大的不便，觀光的人會因而卻步，當地的人他如果有通勤通學的需求，也會影響很大，(相關單位要)掌握需求的人數。」花東地區倚賴鐵路運輸，修復工程分秒必爭，只要一天沒復原，影響將日益擴大。

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