裁定指出，柯文哲陳稱其有安排陳佩琪與其子女一起出國躲避國內紛擾等語，可見其面對偵查時，已有安排全家出國之計畫；而配偶陳佩琪對外宣稱從醫良久，有資力購買上億房產等語，自有在國外生活之能力與資力；以及柯文哲所寫下「晶華-orange出國」等內容，足認柯文哲指示許芷瑜出境。另外，檢調去年8月30日前往柯文哲住家搜索時，陳佩琪當時透露要先從旅館趕回家，也成外界焦點。

今（3日）陳佩琪發文回應，指稱去年8月中開始為避開門口媒體，方便準時上班，「我很多晚都住外面旅館，30日一早家被搜索，我才從旅館（在台北市，非桃機旅館）趕回家」，她表示北檢也問到原定當晚的美國行， 陳佩琪稱來回機票早在6月24日就下訂，檢察官也跟她說「妳可以去」。

陳佩琪表示，8月美國行為私人旅遊、全程自己規劃，「還記得出發前幾天有和先生提了一下，先生一定覺得我整天被媒體包圍也很辛苦，找女兒解相思之苦，順便散散心也好，所以才說他有安排」，陳佩琪表示自己一直遵守偵查不公開，才隱忍不澄清，如今原訂出國行程卻變成他逃亡、要繼續被羈押的理由，更質疑：「我當時要是出境，一定被說我是潛逃？」

陳佩琪強調，自己一向獨立生活，除100年肺腺癌當年柯幫忙安排開刀外，結婚35年來所有生活瑣事一手包辦，「但他心疼我被媒體包圍、無法上班，支持我暫時避開周遭紛擾，沒想到竟變成他被羈押的理由，還要用這種莫須有的指控、凌遲我們到甚麼時候？」

陳佩琪也質疑，北檢已收集犯罪證據4個月，也求刑28年了，何以怕犯人勾串滅證。陳佩琪指出，偵查時要遵守偵查不公開，起訴後一樣飽受不實資訊攻擊，「難道司法可以不講證據，暗箭不斷，毫無人權、錯誤內容都不能澄清、只能挨打？夠了，我不想再保持沉默了……」。