邱垂正今（4日）受訪指出，這次馬英九基金會邀請中生團訪台，陸委會原本是期望推動對等、尊嚴、健康有序的兩岸交流，盼在相互尊重、充分交流的基礎上，為兩岸關係注入善意。

然而，此次中生團未完全遵守行前申請書面內容，涉及矮化台灣，原本承諾不發表活動，還發表與活動無關的政治性言論，造成社會不安，後續將邀集主管機關，依既有行政程序、相關許可辦法，進行行政處分。

據《聯合新聞網》報導，馬英九基金會執行長蕭旭岑表示，邱垂正可能因為繁忙而未充分了解細節，參訪團並未違反任何規定，女同學的言行沒有惡意，也未有涉及政治的發言，僅是在被媒體詢問時作出回應，並非主動表態。對於陸委會揚言要處分，也質疑這是否要斷絕兩岸所有交流，直言：「民進黨政府要走回戒嚴的老路了嗎？」